Уж очень общий вопрос. Влияет, конечно, на разные водоросли по-разному. Предположим, сильное течение провоцирует рост черной бороды и ее распространение. Нитчатка, похоже, тоже любит зоны течения. А вот ксенококкус к течению равнодушен. Какие конкретно водоросли вас интересуют?