Если генерацию пузырьков отключить, то как правило нет, не шумит. А эти пузырьки и не нужны.
Саму помпу на ночь отключать нельзя, фильтр должен работать круглосуточно.
При выборе фильтра обратите внимание на объём и пористость губки.
Чем губка больше - тем лучше. Губка должна быть мелкопористой или среднепористой.